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Thèmes de recherches

Réponses adaptatives


​Nos travaux visent à étudier les mécanismes d'adaptation aux contraintes environnementales de trois modèles bactériens qui représentent des modalités différentes de tolérance aux stress liés à leurs habitats. ​​

Publié le 25 mai 2016

​Ces études sont réalisées dans le cadre de thèmes suivants:

  • La plasticité génomique de Pseudomonas brassicacearum confère un avantage à cette espèce bactérienne dans la rhizosphère d’Arabidopsis thaliana, dans la compétition pour les ressources de son environnement et dans la tolérance aux toxiques potentiellement présents dans sa niche écologique. La plasticité génomique de cette bactérie lui permet de générer une diversité intraclonale et d’exprimer un grand répertoire de gènes sous le contrôle d’ARNs non codants régulateurs (ARNnc). Ces ARNnc sont impliqués dans l’adaptation de la bactérie à la plante et dans son adaptation aux contraintes environnementales.
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  • Un cycle cellulaire sous le contrôle de la lumière, contribue à l’adaptation de Ramlibacter tataouinensis au désert et lui confère la tolérance à la dessiccation et plus largement aux conditions rencontrées dans un désert chaud et sec. R. tataouinensis est une ß-protéobactérie isolée de fragments de météorites ensablés, collectés dans la région semi-désertique de Tataouine (sud tunisien). Cette bactérie du désert a la particularité d’altérer l’orthopyroxène, un constituant majeur de météorites. La forte tolérance de cette bactérie aux conditions extrêmes du désert, et en particulier à la dessiccation, est probablement liée au cycle cellulaire original caractérisé par la coexistence de cellules coccoïdes entourées d’un polymère protecteur (présentant toutes les caractéristiques d’un kyste résistant à la dessiccation : Ø 0,8 µm) et de cellules de type bâtonnet (Ø 0,2 x 3 µm). La mobilité des bâtonnets assure la dissémination de la population permettant la colonisation de nouvelles niches écologiques. L’exploration du génome de R. tataouinensis ainsi que des évidences expérimentales semblent indiquer l’implication de la lumière et du régulateur du cycle circadien KaiC dans le contrôle du cycle cellulaire de cette bactérie. Nos recherches visent à valider ces hypothèses.
 

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