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Standards and models for biology


​Yves Vandenbrouck (currently EDyP team at the Large Scale Biology laboratory) contributed to the book "Systems Biology: Standards and Models for Biology". This pioneering book written by international specialists addresses issues of standardization procedures for the living.

Published on 10 December 2007





Collection: Collection Écrin
isbn: 978-2-916097-12-1
Number of pages: 288
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.........detailed plan.........

Introduction.
page 16

MIAME, MAGE et transcriptome.
pages 21-46

MIAPE, PSI et protéomique.
pages 47-70

LXML, RDF, OWL : langages de description et d’échange de données.
pages 71-96

BFO : pour la standardisation des ontologies biomédicales OBO.
pages 97-122

GO : annotation fonctionnelle.
pages 123-142

Le paradigme IMGT-ONTOLOGY.
pages 143-164

SBML : langage demodélisation des réseaux biochimiques.
pages 165-180
SBGN : notation graphique des réseaux biochimiques.
pages 181-198

Formalismes mathématiques : des standards de fait.
pages 199-214

Physiome : de la molécule à l’organisme.
pages 215-230

CellML : de la cellule au médicament.
pages 231-264

IDM : des standards à une architecture de modèles.
pages 265-283

Index.
page 287

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