"Le département des Technologies pour la Biologie et la Santé du CEA-LETI s'intéresse notamment au développement de nouvelles technologies pour la détection et l'identification rapide de micro-organismes, en particulier de bactéries.Nous avons jusqu'à présent travaillé sur une méthode d'identification non invasive et non destructive par diffraction dans le visible. L'analyse se fait séquentiellement sur les colonies bactériennes individuelles de taille variant entre 300 microns et 4 mm, poussant sur milieu gélosé, support de culture des bactéries. Afin d'automatiser l'identification, il est nécessaire de pouvoir détecter la présence de colonies sur la boite de culture en amont du module d'identification. Par détection, on entend ici établir une cartographie des colonies sur la boite, les compter, et si possible en déterminer la taille. Nous pensons qu'une approche holographique off-axis en réflexion est une solution intéressante pour permettre d'adresser les supports gélosés opaques utilisés majoritairement dans le domaine clinique. L'objectif du stage est de valider la pertinence de cette approche. Pour cela, le stagiaire sera en charge de concevoir et de développer un banc d'holographie en réflexion pour géloses: (1) Il s'appropriera dans un premier temps les approches holographiques en transmission (montage, algorithmes de reconstruction) que nous avons développées au laboratoire pour les milieux gélosés translucides .(2) Dans un second temps, il lui faudra définir et dimensionner les différentes solutions possibles en réflexion (géométrie, supports holographiques). (3) Un banc optique sera ensuite mis en œuvre et caractérisé. Un travail sur la mise en forme des faisceaux objets et de référence sera nécessaire. Des échantillons de calibration et des échantillons biologiques seront mis à disposition pour valider le montage. Une plateforme de microscopie est également à disposition pour conduire des mesures comparatives, pouvant servir de référence.(4) Pour l'analyse des images, le stagiaire pourra s'appuyer sur les algorithmes de reconstruction développés au laboratoire. Ces algorithmes seront ajustés dans l'objectif d'établir une cartographie des colonies présentes sur le milieu nutritif et avoir des informations sur leur morphologie (forme et taille). Ce sujet de stage est un sujet d'instrumentation optique complet, puisqu'il comprend la conception d'un banc optique, sa réalisation, et sa validation sur des échantillons biologiques. Il s'adresse à un étudiant motivé par l'instrumentation optique appliquée à la biologie. "