Institut des sciences du vivant Frédéric Joliot - Sur le même thème https://joliot.cea.fr/drf/joliot/Pages/Actualites/Scientifiques/2020/Composition-microbiote-animaux-in-natura-spectro-masse.aspx Site web de l'Institut des sciences du vivant Frédéric-Joliot qui comprend 4 départements : l'I2BC, le DMTS, NeuroSpin et le Service hospitalier Frédéric Joliot (SHFJ). Les équipes sont localisées principalement sur le centre CEA Paris-Saclay et à l'hôpital d'Orsay. fr-FR https://www.cea.fr/Style%20Library/Themes/drf/instituts/images/logo-cea-joliot-2023.png Institut des sciences du vivant Frédéric Joliot - Sur le même thème https://joliot.cea.fr/drf/joliot Amélioration du diagnostic des porphyries hépatiques aiguës grâce à la spectrométrie de masse https://www.cea.fr/drf/joliot/Pages/Actualites/Scientifiques/2024/Diagnostic-porphyries-hepatiques-aigues-spectrometrie-masse.aspx Une étude collaborative entre le SPI et une équipe de l’Hôpital Louis Mourier démontre l’apport de la chromatographie en phase liquide couplée à la spectrométrie de masse pour répondre aux besoins analytiques quotidiens d'un laboratoire clinique. Application à la quantification rapide de biomarqueurs des porphyries hépatiques aiguës. Diagnostic ; Spectrométrie de masse ; Biomarqueurs SPI Résultat scientifique ; Article Fri, 23 Feb 2024 11:00:00 GMT Focus sur la plateforme de spectrométrie de masse du Li2D, ProGénoMix https://www.cea.fr/drf/joliot/Pages/Actualites/Institutionnelles/2024/Focus-progenomix-SM-Li2d.aspx Le 10 février, le département "Sciences de la Vie" de l'Université Paris-Saclay a publié sur son compte Scoop.it un focus sur la plateforme ProGénoMix, hébergée au Li2D (DMTS/SPI, CEA Marcoule), qui a rejoint en 2023 l’Infrastructure Nationale en Biologie Santé ProFi, spécialisée en protéomique. Spectrométrie de masse ; Biodétection ; Bioinformatique Chercheurs ; Entreprises SPI Focus ; prévisualisation ; Plateforme & installation ; Article Fri, 16 Feb 2024 11:00:00 GMT Décryptage des microbiotes : l’identification d’isolats microbiens fortement accélérée par protéotypage multiplex https://www.cea.fr/drf/joliot/Pages/Actualites/Scientifiques/2023/Identification-isolats-microbiens-par-proteotypage-multiplex.aspx Des chercheurs du SPI proposent une méthode innovante de multiplexage pour l’identification rapide de plusieurs isolats microbiens en une seule analyse de spectrométrie de masse. Une approche qui ouvre des perspectives d’identification à grande échelle des microorganismes issus de programmes de culturomique. Biologie à grande échelle ; Méthodologies pour les sciences du vivant ; Protéomique ; Bactéries SPI Résultat scientifique Fri, 24 Nov 2023 11:00:00 GMT Déficit en transporteur de la créatine : utilisation de deux modèles originaux pour cerner cette maladie génétique rare https://www.cea.fr/drf/joliot/Pages/Actualites/Scientifiques/2023/Proteines-impliquees-pathogenese-deficit-transporteur-creatine.aspx Des chercheurs du SPI/DMTS ont identifié par spectrométrie de masse des biomarqueurs liés au trouble du déficit en transporteur de la créatine (CTD) en utilisant 2 modèles originaux: des souris présentant les caractéristiques cliniques de sujets atteints de CTD et des organoïdes cérébraux dérivés de cellules de patients-CTD Spectrométrie de masse ; Maladies génétiques ; Biomarqueurs ; Protéomique SPI Résultat scientifique Thu, 22 Jun 2023 10:00:00 GMT Peut-on conditionner les protéines dans du plastique ? https://www.cea.fr/drf/joliot/Pages/Actualites/Scientifiques/2023/biotherapies-peut-on-conditionner-les-proteines-dans-du-plastique.aspx Selon une étude menée par les instituts Iramis et Joliot avec leurs partenaires, des protéines en solution peuvent être déstabilisées au contact des parois d'un flacon en plastique, puis former des agrégats protéiques dégradés. Un point d'attention pour le conditionnement des protéines thérapeutiques. Diagnostic et thérapies innovantes ; Mécanismes moléculaires ; Protéomique Chercheurs ; Grand public ; Journalistes Joliot Découvertes et avancées ; Résultat scientifique Wed, 22 Mar 2023 11:00:00 GMT Des variations génétiques de régions régulatrices de l’ADN acquises au cours de l’évolution affectent la morphologie de certains sillons du cortex cérébral humain https://www.cea.fr/drf/joliot/Pages/Actualites/Scientifiques/2023/Variations-genetiques-regions-regulatrices-morphologie-sillons-corticaux.aspx En utilisant les données d'imagerie-génétique de l'UK Biobank, une étude menée par NeuroSpin a découvert que la variation de régions génomiques amplificatrices pouvait affecter la morphologie de sillons corticaux et être associée à l'évolution de la locomotion chez les primates, puis à la bipédie chez nos ancêtres homininés. IRM ; Génomique ; Cerveau NeuroSpin Résultat scientifique Mon, 27 Feb 2023 11:00:00 GMT Identification rapide et à grande échelle du microbiote pulmonaire de la mucoviscidose par métaprotéomique https://www.cea.fr/drf/joliot/Pages/Actualites/Scientifiques/2023/Identification-microbiote-pulmonaire-mucoviscidose-metaproteomique.aspx Une équipe du Li2D a utilisé la spectrométrie de masse en tandem pour identifier les micro-organismes présents dans des échantillons d’expectoration de patients atteints de mucoviscidose. Une approche prometteuse de protéotypage qui apporte une vue élargie et non biaisée du microbiote et pourrait être complémentaire de la surveillance microbiologique des patients. Biologie à grande échelle ; Méthodologies pour les sciences du vivant ; Protéomique SPI Résultat scientifique Tue, 14 Feb 2023 11:00:00 GMT D’une toxine marine à un antagoniste du récepteur de la mélanocortine, cible thérapeutique des troubles du métabolisme énergétique https://www.cea.fr/drf/joliot/Pages/Actualites/Scientifiques/2023/Toxine-cone-marin-antagoniste-recepteur-melanocortine.aspx Une équipe du SIMoS découvre, dans le venin d’un cône marin, une toxine qu’elle dérive par ingénierie en un peptide antagoniste à forte affinité pour le récepteur de la mélanocortine, régulateur majeur de l’homéostasie énergétique. Un pas vers le développement de traitements inédits de certains troubles de l’alimentation. Santé & sciences du vivant ; Pharmacologie ; Criblage haut débit ; Protéomique ; Transcriptomique SIMOPRO Résultat scientifique Thu, 09 Feb 2023 11:00:00 GMT Monkeypox : le LI2D ouvre le journal de France 3 Occitanie – Pays Gardois https://www.cea.fr/drf/joliot/Pages/Actualites/espace_presse/chercheurs-media/Monkeypox-LI2D-France-3-Occitanie-Pays-Gardois.aspx Le mercredi 26 octobre, l’édition locale du Pays Gardois du journal 19/20 de France 3 Occitanie ouvrait sur la présentation du laboratoire LI2D de Marcoule. Laurent Bellanger, responsable du LI2D, et Jean Armengaud, son adjoint, ont présenté les récents succès du laboratoire pour la détection et la description du virus de la variole du singe. Maladies infectieuses ; Spectrométrie de masse ; Diagnostic Grand public SPI Interview ; Reportage immunoanalyse;pathogène; Thu, 03 Nov 2022 11:00:00 GMT Le génome d’une louve de la grotte Chauvet et son alimentation révélés par l’ADN ancien https://www.cea.fr/drf/joliot/Pages/Actualites/Scientifiques/2022/Genome-louve-grotte-Chauvet.aspx Dans le cadre du projet de recherche interdisciplinaire consacré à la grotte Chauvet, une équipe de l’I2BC, du MNHN et de l’Ins. Génétique & Développement (Rennes), a étudié, par des approches multidisciplinaires allant de la datation 14C à l'analyse des génomes anciens, un excrément fossilisé qui s'est avéré être celui d'un canidé ayant consommé de l'ours des cavernes. Génomique ; ADN SBIGEM Résultat scientifique ; Article Fri, 30 Sep 2022 10:00:00 GMT Le LI2D et la startup Phylogene s’associent pour améliorer l’analyse des microbiotes https://www.cea.fr/drf/joliot/Pages/Actualites/espace_presse/Communiques/LI2D-Phylogene-DeepMicro.aspx Le LI2D s’est récemment associé à la société Phylogene (Nîmes), au travers du projet DeepMicro qui vise à développer de nouvelles techniques d’analyses, plus puissantes. L’acquisition d’un spectromètre de masse à très haute résolution, grâce au soutien financier de la Région Occitanie, constitue une étape décisive dans la mise en œuvre du projet. Le CEA et Phylogene ont publié un communiqué de presse le 10 mai. Protéomique Entreprises ; Institutionnels ; Journalistes ; Grand public Marcoule Communiqué de presse spectrométrie de masse;microbiome; Fri, 13 May 2022 10:00:00 GMT Un possible lien entre des modifications du microbiote intestinal et la charge fécale en SARS-CoV-2 ? https://www.cea.fr/drf/joliot/Pages/Actualites/Scientifiques/2022/Lien-microbiote-intestinal-Covid-19.aspx Une équipe du SPI (DMTS, Marcoule) a utilisé la spectrométrie de masse pour analyser le degré d’altération du microbiote intestinal de patients Covid-19 et pour rechercher des signatures de l’infection intestinale par le virus SARS-CoV-2. La dysbiose observée chez ces patients pourrait être un indicateur du stade et de l'importance de l'infection. Spectrométrie de masse ; Protéomique ; Biomarqueurs ; Maladies infectieuses SPI Résultat scientifique ; Article Thu, 12 May 2022 10:00:00 GMT ProMetIS : données et outils bioinformatiques ouverts pour le phénotypage multi-omiques de modèles murins https://www.cea.fr/drf/joliot/Pages/Actualites/Scientifiques/2022/ProMetIS-base-ouverte-phenotypage-multi-omiques.aspx Un consortium de chercheurs, piloté par le SPI/DMTS, présente ProMetIS, une étude pilote pour le phénotypage approfondi de lignées murines par combinaison d’approches protéomiques et métabolomiques. Une avancée significative pour la caractérisation fonctionnelle des gènes et le développement d’approches d’intégration bioinformatiques. Spectrométrie de masse ; Biologie à grande échelle ; Bioinformatique SPI Résultat scientifique Mon, 04 Apr 2022 10:00:00 GMT L’architecture génétique de la connectivité fonctionnelle du langage dévoilée https://www.cea.fr/drf/joliot/Pages/Actualites/Scientifiques/2022/Architecture-genetique-connectivite-fonctionnelle-langage.aspx En utilisant les données de l’UK Biobank, la plus grande cohorte d'imagerie-génétique sur population générale, une collaboration menée par une équipe de BAOBAB (NeuroSpin) a identifié des gènes impliqués dans l’architecture génétique de la connectivité fonctionnelle du langage. Ces gènes pourraient être prioritaires pour étudier le langage naturel. Cerveau ; Cognition ; IRM ; Génomique NeuroSpin Résultat scientifique Mon, 14 Feb 2022 11:00:00 GMT L’analyse biochimique et la spectrométrie de masse au service du diagnostic des anomalies congénitales de la glycosylation https://www.cea.fr/drf/joliot/Pages/Actualites/Scientifiques/2022/Diagnostic-SM-anomalies-congenitales-glycosylation.aspx Une collaboration initiée en 2017 entre l’AP-HP (hôpital Bichat), l’Université Paris-Saclay (Inserm 1193) et le Laboratoire d’Études du Métabolisme des Médicaments (SPI/DMTS), ayant conduit à 4 publications en 2021, fait progresser la connaissance sur l’origine de certains troubles congénitaux de la glycosylation, grâce à l’identification de biomarqueurs biochimiques spécifiques. Spectrométrie de masse ; Maladies génétiques ; Biomarqueurs SPI Résultat scientifique Tue, 04 Jan 2022 11:00:00 GMT La métaprotéomique et la science des données pour un diagnostic d’éco-santé du microbiote des sols https://www.cea.fr/drf/joliot/Pages/Actualites/Scientifiques/2021/Metaproteomique-science-donnees-microbiote-sols.aspx Des chercheurs du Li2D (SPI/DMTS, Marcoule) et du LSCE ont développé une méthodologie innovante d’analyse du microbiote des sols reposant sur une interprétation informatique optimale des bases de données de métaprotéomique qui devrait notamment permettre de mieux comprendre l’impact des polluants sur la qualité des sols et de prédire leur potentiel de restauration. Environnement ; Protéomique ; Spectrométrie de masse ; Bactéries LSCE Résultat scientifique Thu, 07 Oct 2021 10:00:00 GMT AMR DetecTool : “success story” de l’EIT Health France https://www.cea.fr/drf/joliot/Pages/Actualites/Institutionnelles/2021/AMR-DetecTool-EIT-HEalth.aspx ​Le bureau français de l’EITH Health publie régulièrement des « success stories » des projets que l’instrument Horizon 2020 a financés. AMR DetecTool, coordonné par Hervé Volland (LERI/SPI/DMTS) a ainsi bénéficié d’une campagne de communication sur le web et les réseaux sociaux. Bactéries ; Maladies infectieuses Chercheurs SPI Partenariat Europe & international ; Article antibiorésistance; Wed, 04 Aug 2021 10:00:00 GMT Imagerie des sillons cérébraux et génétique : la cohorte UK Biobank a parlé https://www.cea.fr/drf/joliot/Pages/Actualites/Scientifiques/2021/Imagerie-sillons-cerebraux-genetique.aspx Des chercheurs de BAOBAB (NeuroSpin) et du CNRGH (institut Jacob) ont étudié, à l’échelle du génome entier, les potentielles associations d’haplotypes (ensemble de variants situés côte à côte sur un chromosome) à la valeur d’ouverture de sillons cérébraux imagés, indicateur du vieillissement cérébral, à partir de la cohorte de neuroimagerie-génétique UK Biobank. IRM ; Génomique ; Cerveau NeuroSpin Résultat scientifique Mon, 19 Apr 2021 10:00:00 GMT Salmonelloses et shigelloses : un anticorps monoclonal induit une protection croisée https://www.cea.fr/drf/joliot/Pages/Actualites/Scientifiques/2021/Salmonelloses-shigelloses-anticorps-monoclonal-protection-croisee.aspx Des chercheurs du CEA-Joliot (SPI en collaboration avec le SIMoS) ont développé un anticorps monoclonal dirigé contre une région commune de deux protéines des bactéries Shigella et Salmonella et capable d’induire une protection croisée contre des infections dues à ces bactéries. Bactéries ; Vaccin Chercheurs SIMOPRO Résultat scientifique anticorps;IpaD-318;cellule hôte;injectiosome; Thu, 25 Mar 2021 11:00:00 GMT Intoxication alimentaire ? La spectrométrie de masse ciblée mène l’enquête https://www.cea.fr/drf/joliot/Pages/Actualites/Scientifiques/2021/Intoxication-alimentaire-SE-spectrometrie-masse-ciblee.aspx Le SPI (DMTS), en collaboration avec l’ANSES, a mis au point un test reposant sur l’immuno-capture et la spectrométrie de masse ciblée pour l’identification quantitative et multiplexe, dans les produits laitiers, des huit principales entérotoxines de Staphylococcus aureus, responsables d’épidémies d'intoxication alimentaire. Spectrométrie de masse ; Toxicologie ; Risques NRBC-E SPI Résultat scientifique Thu, 18 Mar 2021 11:00:00 GMT Première étape vers un test quantitatif par spectrométrie de masse pour le diagnostic spécifique de la COVID-19 ? https://www.cea.fr/drf/joliot/Pages/Actualites/Scientifiques/2021/Vers-test-quantitatif-MS-diagnostic-specifique-COVID-19.aspx Le LEMM, en collaboration avec le LI2D et l’AP-HP, développe un test de diagnostic spécifique de la Covid-19 par spectrométrie de masse qui permettrait aussi la quantification de la charge virale du patient. Objectif à terme : adapter la méthode pour la rendre plus sensible et compatible avec les équipements d’analyse des hôpitaux. Diagnostic ; Spectrométrie de masse ; Virus Chercheurs SPI Résultat scientifique SARS-CoV-2; Tue, 09 Mar 2021 11:00:00 GMT Couronne protéique autour des nanoparticules : une affaire de taille ! https://www.cea.fr/drf/joliot/Pages/Actualites/Scientifiques/2021/couronne-proteique-autour-des-nanoparticules--une-affaire-de-taille-.aspx Plongées dans des milieux biologiques, les nanoparticules sont aussitôt « enveloppées » de protéines. Une étude menée par des chercheurs des instituts Iramis et Joliot (I2BC) précise l’importance de la taille des protéines sur la formation de cette enveloppe et recommande une meilleure prise en compte de ce paramètre dans les études protéomiques et nanotoxicologiques. Micro-nanotechnologies ; Protéomique ; Nanomédecine ; Nanotoxicologie Chercheurs ; Grand public Joliot Résultat scientifique Wed, 03 Mar 2021 11:00:00 GMT Microbiote intestinal : fonctionnement d’une bactérie vampire https://www.cea.fr/drf/joliot/Pages/Actualites/espace_presse/Communiques/Microbiote-intestinal-bacterie.aspx Des chercheurs d’INRAE, en collaboration avec le CEA, ont mis en lumière l’existence d’un capteur sur Enterococcus faecalis qui permet à la bactérie de détecter la présence d’hème et de contrôler finement ses apports pour ne pas subir sa toxicité. Publiés le 2 février 2021 dans mBio , ces travaux constituent une piste pour bloquer ce mécanisme et développer des traitements contre cette bactérie. Recherche fondamentale ; Santé & sciences du vivant ; Bactéries ; Maladies Grand public ; Journalistes ; Chercheurs DRF Actualité ; Communiqué de presse ; Découvertes et avancées MICROBIOTE;antibiotique;faecalis;instestin;BACTERIE; Tue, 02 Feb 2021 11:00:00 GMT Le SPI s’engage pour une médecine de précision en faveur des maladies auto-immunes et inflammatoires https://www.cea.fr/drf/joliot/Pages/Actualites/Institutionnelles/2021/SPI-consortium-ATRACTion.aspx Coordonné par l’institut des maladies génétiques Imagine, le programme ATRACTion repose sur un consortium de 11 partenaires académiques et industriels, dont le SPI (DMTS), et vise à développer une médecine de précision pour les patients présentant des maladies auto-immunes et inflammatoires associées à des déficits immunitaires primaires. Métabolomique ; Spectrométrie de masse ; Maladies autoimmunes Actualité Thu, 14 Jan 2021 11:00:00 GMT Incroyable découverte : Variovorax, une bactérie qui vit au cœur d’un réacteur nucléaire en fonctionnement ! https://www.cea.fr/drf/joliot/Pages/Actualites/Scientifiques/2020/Variovorax-bacterie-vivant-cœur-reacteur-nucleaire.aspx Des chercheurs de l’I2BC et du SPI (DMTS, Marcoule), en collaboration avec le CEA Grenoble et le centre de recherche nucléaire belge, découvrent, grâce à deux approches méta-omiques, des bactéries vivantes dans la piscine du cœur du réacteur de recherche du CEA Paris-Saclay, Osiris, en fonctionnement. Bactéries ; Toxicologie nucléaire SB2SM Résultat scientifique Thu, 17 Dec 2020 11:00:00 GMT Le fonctionnement des synthases de cyclodipeptides élucidé grâce aux flexizymes https://www.cea.fr/drf/joliot/Pages/Actualites/Scientifiques/2020/Fonctionnement-synthases-cyclodipeptides-flexizymes.aspx Une équipe de l’I2BC (SBIGeM), en collaboration avec le DMTS, a mis à profit la technologie des flexizymes pour élucider le fonctionnement des synthases de cyclodipeptides, enzymes à l’origine de la synthèse des 2,5-dicétopipérazines, composés de nature peptidique, naturels ou synthétiques, qui représentent une source inégalée de molécules bioactives pour la pharmacopée. Santé & sciences du vivant ; Bactéries SCBM Résultat scientifique Thu, 05 Nov 2020 11:00:00 GMT Composition du microbiote d’animaux in natura : un défi relevé par la spectrométrie de masse. https://www.cea.fr/drf/joliot/Pages/Actualites/Scientifiques/2020/Composition-microbiote-animaux-in-natura-spectro-masse.aspx Une équipe du SPI à Marcoule, en collaboration avec l’INRAE, a caractérisé le microbiote intestinal d’un petit crustacé utilisé comme sentinelle de la qualité des eaux en France, en combinant des approches de protéogénomique et de métaprotéomique, ouvrant ainsi d’intéressantes perspectives pour l’analyse des interactions hôte/microbiote chez d’autres modèles animaux. Spectrométrie de masse ; Bactéries ; Génomique ; Protéomique Marcoule Résultat scientifique Mon, 24 Aug 2020 10:00:00 GMT Détection de SARS-CoV-2 : la spectrométrie de masse montre son potentiel de rapidité. https://www.cea.fr/drf/joliot/Pages/Actualites/Scientifiques/2020/Detection-SARS-CoV-2-SpectroMasse-rapide.aspx Une équipe du SPI à Marcoule a détecté par spectrométrie de masse des peptides signatures du virus SARS-CoV-2 dans des échantillons cliniques (écouvillons nasals sur patients Covid-19). Elle apporte une preuve de concept de l'utilisation de cette méthode comme alternative possible à la PCR, actuellement méthode de référence. Spectrométrie de masse ; Virus ; Biodétection ; Diagnostic Marcoule Résultat scientifique Thu, 06 Aug 2020 10:00:00 GMT Rétrotransposon Ty1 : une courte séquence peptidique détermine son insertion dans le génome https://www.cea.fr/drf/joliot/Pages/Actualites/Scientifiques/2020/Retrotransposon-Ty1-courte-sequence-peptidique-pour-insertion-genome.aspx ​Des chercheurs de l'Institut de Recherche Saint Louis et de l'I2BC identifient un motif protéique responsable de la spécificité d'insertion du rétrotransposon Ty1 dans le génome de la levure. Ce motif pourrait servir à adapter des vecteurs de thérapie génique et en limiter le potentiel mutagène. Génomique SBIGEM Résultat scientifique intégrase; Wed, 29 Jul 2020 10:00:00 GMT Banque Venomics : découverte de deux toxines régulant l’activité de récepteurs aux mélanocortines https://www.cea.fr/drf/joliot/Pages/Actualites/Scientifiques/2020/Venomics-2-toxines-MC4R.aspx Dans un article publié dans le Journal of Medicinal Chemistry, le consortium Venomics mené par une équipe du SIMoS montre l’intérêt de créer des banques de toxines pour identifier des molécules régulant des cibles thérapeutiques. Criblage haut débit ; Protéomique ; Transcriptomique SIMOPRO Résultat scientifique Thu, 23 Jul 2020 10:00:00 GMT Bactéries et archées : une nouvelle taxonomie pour mieux décrire les inconnues ? https://www.cea.fr/drf/joliot/Pages/Actualites/Scientifiques/2020/Nouvelle-taxonomie-bacteries-archees.aspx ​La découverte de myriades de nouvelles espèces de bactéries et archées, liée à l’explosion de la métagénomique, amène les microbiologistes à envisager de repenser la façon de cartographier certaines branches du vivant. Des outils, comme la phylopeptidomique conçue au Li2D, pourraient les y aider. Spectrométrie de masse ; Bactéries ; Protéomique Chercheurs SPI Article Mon, 20 Jul 2020 10:00:00 GMT Analyse protéomique de cellules infectées par le virus SARS-CoV-2 https://www.cea.fr/drf/joliot/Pages/Actualites/Scientifiques/2020/Analyse-proteomique-cellules-infectees-SARS-CoV-2.aspx Afin d’optimiser l’amplification de virus inactivé de qualité, en vue de la fabrication d’un vaccin, une équipe du SPI à Marcoule a utilisé la spectrométrie de masse pour analyser la dynamique du protéome de cellules infectées par le SARS-CoV-2, responsable de la Covid-19, à deux multiplicités d’infection. Avec plus de 3220 protéines de l’hôte identifiées, les chercheurs commencent également à décrypter les processus et réseaux cellulaires impactés par ce virus. Virus ; Spectrométrie de masse ; Protéomique Résultat scientifique Mon, 06 Jul 2020 10:00:00 GMT La traque aux peptides signatures de SARS-CoV-2 est lancée ! https://www.cea.fr/drf/joliot/Pages/Actualites/Scientifiques/2020/Proteomique-peptides-signatures-SARS-CoV-2.aspx Des chercheurs du SPI (Marcoule) ont utilisé la protéomique pour identifier des peptides signatures du virus SARS-CoV-2 exprimés in vitro. Une « short list » de 14 peptides identifiés et caractérisés permet d’envisager des développements en spectrométrie de masse ciblée, faisant de cette approche à grande échelle directe et rapide, implantable en milieu hospitalier, un potentiel outil de choix dans la détection du virus responsable de la Covid-19. Protéomique ; Virus ; Spectrométrie de masse Résultat scientifique Fri, 05 Jun 2020 10:00:00 GMT Focus sur la plateforme MetaboHub/Metabolome-IdF https://www.cea.fr/drf/joliot/Pages/Actualites/Institutionnelles/2020/Focus-plateforme-MetaboHub.aspx L'Université Paris-Saclay fait un focus sur la plateforme Metabolome-IdF, l'un des deux sites franciliens de l'Infrastructure en Biologie et Santé, MetaboHub, spécialisée en métabolomique et fluomique. Spectrométrie de masse ; Métabolomique ; Pharmacologie SPI Focus ; prévisualisation INBS;MALDI-TOF;tandem mass spectrometry; Mon, 18 May 2020 10:00:00 GMT Comment l’identification de formes atténuées du virus SARS-CoV-2 pourrait aider à maitriser l’épidémie actuelle ? https://www.cea.fr/drf/joliot/Pages/Actualites/Institutionnelles/2020/Variants-attenues-Covid-Sars-CoV2.aspx Un article d’opinion, publié dans Environmental Microbiology et rédigé par un consortium international initié par trois chercheurs de l’Institut Joliot, propose une voie originale de recherches sur le Covid-19 au travers de l’identification par séquençage de variants atténués du virus SARS-CoV-2 dans des populations à risque peu ou non symptomatiques. Virus ; Génomique ; Vaccin Actualité Mon, 11 May 2020 10:00:00 GMT Focus sur la plateforme SMArt-MS https://www.cea.fr/drf/joliot/Pages/Actualites/Institutionnelles/2020/Focus-plateforme-SMArt-MS.aspx L'Université Paris-Saclay fait un focus sur la plateforme SMArt-MS du Service de Pharmacologie et Immunoanalyse, spécialisée dans le développement et la validation de méthodes de bioanalyse quantitative par LC-MS/MS de petites moléculules et d'anticorps thérapeutiques pour la réalisation d'études de métabolisme et pharmacocinétique pilotes. Spectrométrie de masse ; Métabolomique ; Pharmacologie SPI Focus ; prévisualisation Pharmacocinétique;ADME-DMPK; Thu, 23 Apr 2020 10:00:00 GMT Phylopeptidomique : un nouvel outil d’analyse des microbiotes https://www.cea.fr/drf/joliot/Pages/Actualites/Scientifiques/2020/Phylopeptidomique-analyse-microbiotes.aspx ​Des chercheurs du LI2D (Marcoule) ont développé une méthode mathématique pour identifier la contribution de chacun des organismes qui composent un microbiote dans un jeu de données de métaprotéomique. Cette méthode, la phylopeptidomique, est décrite dans le journal Microbiome. Protéomique ; Biodiversité SPI Résultat scientifique Microbiologie; Mon, 06 Apr 2020 10:00:00 GMT Caractérisation d’un biomarqueur de prédiction de survie en cas de choc septique https://www.cea.fr/drf/joliot/Pages/Actualites/Scientifiques/2020/Caracterisation-biomarqueur-survie-choc-septique.aspx Deux études récentes menées par des chercheurs du SPI, en collaboration avec des équipes de l’Inserm et de l’AP/HP, révèlent l’intérêt de la mesure des taux plasmatiques des calgranulines comme biomarqueurs de prédiction du risque de mortalité de patients admis en unité de soins intensifs en état de choc septique. Biomarqueurs ; Maladies infectieuses ; Spectrométrie de masse Résultat scientifique Tue, 24 Mar 2020 11:00:00 GMT Une piste pour éradiquer les infections de l'estomac de la moitié de la population mondiale https://www.cea.fr/drf/joliot/Pages/Actualites/espace_presse/Communiques/piste-pour-éradiquer-les-infections-de-l'estomac.aspx Une collaboration franco-indienne a identifié un mécanisme important dans la transmission de résistances aux antibiotiques qui sont la cause majeure de l’échec des thérapies visant l’éradication de Helicobacter pylori, bactérie qui infecte la moitié de la population mondiale. Ce résultat fait l’objet d’une publication dans Nature Communication, le 25 novembre 2019. Santé & sciences du vivant ; Maladies ; Bactéries ; Maladies infectieuses Chercheurs ; Enseignants ; Grand public ; personnes handicapées ; Jeunes ; Collège ; Etudes supérieures ; Lycée ; Primaire ; Journalistes Jacob Actualité ; Communiqué de presse ; A la une ; Focus Mon, 25 Nov 2019 11:00:00 GMT Alzheimer ou démence à corps de Lewy ? La réponse avec la spectrométrie de masse haute résolution. https://www.cea.fr/drf/joliot/Pages/Actualites/Scientifiques/2019/Alzheimer-demence-corps-Lewy-reponse-avec-SM.aspx Une équipe du SPI, en collaboration avec le service de Biochimie métabolique et l’Institut de la Mémoire et de la Maladie d’Alzheimer (IM²A) des hôpitaux universitaires Pitié-Salpêtrière, a développé une méthode de quantification simultanée des protéines tau et α-synucléine dans le liquide céphalo-rachidien humain par spectrométrie de masse à haute résolution. Une nouvelle approche prometteuse pour le diagnostic différentiel de la démence à corps de Lewy et de la maladie d’Alzheimer. Maladies neurodégénératives ; Diagnostic ; Spectrométrie de masse Résultat scientifique défi1; Thu, 07 Nov 2019 11:00:00 GMT Fièvre de Lassa : un vaccin bientôt à l’essai https://www.cea.fr/drf/joliot/Pages/Actualites/Scientifiques/2019/Fievre-Lassa-vaccin-bientot-en-essai.aspx Des chercheurs de l’institut Pasteur, en collaboration avec sept équipes de recherche, dont le SPI (LI2D/Marcoule), ont développé et évalué l’efficacité de plusieurs candidats-vaccins contre le virus responsable de la fièvre hémorragique Lassa, endémique en Afrique de l’Ouest. Ils ont identifié l’un d’eux comme étant le plus efficace, susceptible d’entrer rapidement en phase d’essais cliniques chez l’Homme. Les résultats sont publiés dans le journal Science Translational Medicine. Vaccin ; Protéomique ; Virus Résultat scientifique Wed, 09 Oct 2019 10:00:00 GMT Comment la machinerie transcriptionnelle recrute une protéine de réparation de l’ADN ? https://www.cea.fr/drf/joliot/Pages/Actualites/Scientifiques/2019/transcription-reparation-ADN.aspx ​Un travail récent du SBIGeM (I2BC@Saclay) met en évidence comment deux composants essentiels de la transcription de l'ADN en ARN se coordonnent pour recruter la protéine de réparation de l'ADN Rad2/XPG, liant ainsi ces deux processus fondamentaux pour la cellule. ADN ; Génomique ; Mécanismes cellulaires Résultat scientifique Thu, 22 Aug 2019 10:00:00 GMT Une nouvelle interface protéique mutée dans des syndromes de vieillissement prématuré https://www.cea.fr/drf/joliot/Pages/Actualites/actualites/actualites_scientifiques/2018/nouvelle-interface-proteique.aspx ​Une équipe du SB2SM (I2BC@Saclay) a résolu par cristallographie la structure d'un complexe protéique ternaire, à l'interface entre l'enveloppe nucléaire (émerine et lamine A/C) et le génome (BAF). En collaboration avec des équipes des universités Paris-Sud et Paris-Diderot, l'analyse de cette structure ainsi que des expériences d'interaction in vitro et de proximité in cellulo, suggèrent qu'un défaut d'interaction entre la lamine A/C (nucléosquelette) et une protéine associée à la chromatine (BAF) pourrait constituer l'un des mécanismes responsables des syndromes de vieillissement prématuré. Protéomique Résultat scientifique Thu, 20 Sep 2018 10:00:00 GMT La spectrométrie de masse au service du contrôle qualité des vaccins https://www.cea.fr/drf/joliot/Pages/Actualites/actualites/actualites_scientifiques/2018/spectrometrie-controle-qualite-vaccins.aspx ​Une équipe du SPI (LI2D, Marcoule), en collaboration avec le CIRAD et l’AU-PANVAC, propose une nouvelle technique de contrôle qualité de vaccins vétérinaires, reposant sur la spectrométrie de masse à très haute résolution. Cette stratégie, qui s’appuie sur l’utilisation d’une base de données ad hoc pour mesurer la proportion d’antigènes et de contaminants dans la préparation vaccinale, permettra d’améliorer le contrôle de la qualité des vaccins contre la pleuropneumonie contagieuse caprine. Vaccin ; Spectrométrie de masse Résultat scientifique Thu, 05 Jul 2018 10:00:00 GMT Un serveur pour prédire la structure de complexes protéiques, basé sur des données de coévolution https://www.cea.fr/drf/joliot/Pages/Actualites/actualites/actualites_scientifiques/2018/serveur-predire-structure-complexes-proteiques.aspx ​Une équipe de l'I2BC@Saclay (SB2SM), en collaboration avec la plateforme RPBS, a mis en ligne un serveur de prédiction structurale des interactions entre protéines. Ce serveur, conçu pour les biologistes, utilise l'information fournie par la coévolution des séquences protéiques et prédit la structure de complexes protéiques, une information essentielle pour la compréhension de leur rôle fonctionnel. Protéomique ; Informatique Résultat scientifique Thu, 07 Jun 2018 10:00:00 GMT Importance des modifications chimiques des protéines pour leurs interactions avec les nanoparticules https://www.cea.fr/drf/joliot/Pages/Actualites/actualites/actualites_scientifiques/2018/modifications-proteines-nanoparticules.aspx Deux équipes de l’I2BC@Saclay et du SPI (LI2D, Marcoule), en collaboration avec l’IRAMIS, mettent en évidence l’affinité très forte de nanoparticules de silice pour des protéines à motifs RGG (famille de protéines de liaison de l’ARN), particulièrement lorsque celles-ci sont méthylées. Ces résultats sont importants pour le développement d’approches « safe by design ». Nanotoxicologie ; Nanomatériaux ; Protéomique Résultat scientifique Thu, 24 May 2018 10:00:00 GMT Une avancée dans la compréhension des échanges entre molécules d’ADN lors de la recombinaison https://www.cea.fr/drf/joliot/Pages/Actualites/actualites/actualites_scientifiques/2018/echanges-molecules-recombinaison.aspx Un travail collaboratif entre le SBIGeM (I2BC@Saclay) et le Centre de recherche en cancérologie de Marseille, publié dans Molecular Cell, éclaire les bases mécanistiques et le contrôle génétique de la recombinaison homologue, un mécanisme de réparation des cassures de l’ADN responsable des échanges chromosomiques lors de la méiose. Or, les modèles canoniques n’expliquent pas la complexité des profils de recombinaison méiotique et cette étude, qui reconstruit des intermédiaires réactionnels, constitue une avancée majeure dans la compréhension de ce mécanisme. ADN ; Génomique Résultat scientifique Tue, 15 May 2018 10:00:00 GMT L’analyse métabolomique facilitée par la spectrométrie de masse à très haute résolution https://www.cea.fr/drf/joliot/Pages/Actualites/actualites/actualites_scientifiques/2018/analyse-metabolomique-facilitee-par-spectrometrie-de-masse.aspx Dans une étude publiée dans Analytical Chemistry, l'équipe de spectrométrie de masse du Laboratoire d'Etude du Métabolisme des Médicaments (SPI) a démontré l'intérêt de l'Orbitrap Fusion, un spectromètre de masse de dernière génération pour l'identification de métabolites d'intérêt sur la base de leurs masses et isotopes mesurés avec une grande précision. Métabolomique ; Spectrométrie de masse ; Chimie Résultat scientifique Wed, 25 Apr 2018 10:00:00 GMT 1er Symposium de Génomique Fonctionnelle du CEA https://www.cea.fr/drf/joliot/Pages/Actualites/actualites/actualites_institutionnelles/2018/premier-Symposium-Genomique-Fonctionnelle-CEA.aspx Le 4 et 5 avril dernier s'est tenu le 1er symposium de génomique fonctionnelle du CEA. Le meeting, piloté par le CNRGH (Centre national de recherche en Génomique Humaine) s'est déroulé sur le site CEA de Fontenay-aux-Roses. De nombreux chercheurs de l'institut Frédéric Joliot ont été invités. Institutionnel ; Génomique Actualité Mon, 09 Apr 2018 10:00:00 GMT Les fantômes de la fluorescence https://www.cea.fr/drf/joliot/Pages/Actualites/actualites/actualites_scientifiques/2018/les-fantomes-de-la-fluorescence.aspx ​La biologie cellulaire fait appel au marquage fluorescent, une technique incontournable pour suivre la vie de la cellule. Mais les protéines fluorescentes ont leurs limites, que les chercheurs de l'IBS et de l'I2BC@Saclay (SB2SM) essaient de repousser. Biologie structurale ; Protéomique Résultat scientifique Wed, 28 Mar 2018 10:00:00 GMT Une astuce de la nature: un cluster d'eau rend l’activation d’une photolyase de l’ADN plus efficace https://www.cea.fr/drf/joliot/Pages/Actualites/actualites/actualites_scientifiques/2018/cluster-eau-photolyase.aspx ​En collaboration avec une équipe allemande de l'Université de Marburg, Pavel Müller et Klaus Brettel (I2BC@Saclay/SB2SM) ont étudié les premières étapes de la photoactivation d'une photolyase classe II de l'archéobactérie Methanosarcina mazei par spectroscopie optique résolue en temps et ont découvert une particularité de cette classe de photolyases : la séparation photo-induite des charges est stabilisée par un cluster d'eau, un élément structurel conservé également chez les photolyases classe II de plantes et d'animaux. Bactéries ; Photosynthèse Résultat scientifique Wed, 14 Feb 2018 11:00:00 GMT Régulation de la transcription par le Médiateur : avancées récentes https://www.cea.fr/drf/joliot/Pages/Actualites/actualites/actualites_scientifiques/2018/regulation-transcription-mediateur.aspx Julie Soutourina (I2BC@Saclay/SBIGeM) a été invitée par Nature Reviews Molecular Cell Biology à publier une revue sur le fonctionnement moléculaire du Médiateur, un complexe multi-protéique, conservé de la levure à l'homme, et essentiel à la régulation de l'expression des gènes. Les approches thérapeutiques potentielles ciblant le Médiateur (cancer, infections fongiques) y sont également traitées.​ Génomique ; Transcriptomique Résultat scientifique Wed, 17 Jan 2018 11:00:00 GMT Un perturbateur des endosomes tardifs aux propriétés anti-infectieuses https://www.cea.fr/drf/joliot/Pages/Actualites/actualites/actualites_scientifiques/2018/perturbateur-endosomes-tardifs.aspx ​Une équipe du SIMOPRO, en collaboration avec une équipe du SCBM, a identifié par criblage d'une banque de petites molécules chimiques un composé capable de réduire la sensibilité des cellules à une toxine de plante, la ricine. En collaborant avec sept équipes de microbiologistes, les chercheurs ont montré que ce composé, appelé ABMA, protège les cellules en bloquant une voie de transport intracellulaire empruntée par de nombreuses autres toxines bactériennes et pathogènes intracellulaires. ABMA définit ainsi une nouvelle famille d'agents anti-infectieux à large spectre. Bactéries ; Criblage haut débit Résultat scientifique Tue, 16 Jan 2018 11:00:00 GMT Antibiorésistance : un projet de l’institut Joliot financé par l’EIT Health https://www.cea.fr/drf/joliot/Pages/Actualites/actualites/actualites_scientifiques/2017/Antibioresistance_eit_health_joliot.aspx ​Une équipe du SPI/LERI a récemment développé de nouveaux tests-bandelettes pour la détection de certaines bactéries multi-résistantes. Un projet d'implantation hospitalière de ces tests de dépistage ultra-rapides se déploiera en 2018 grâce à un financement de l'EIT Health. Antibiotique ; Bactéries Résultat scientifique Wed, 29 Nov 2017 11:00:00 GMT De nouveaux tests rapides de détection de l’antibiorésistance disponibles sur le marché https://www.cea.fr/drf/joliot/Pages/Actualites/actualites/actualites_scientifiques/2017/nouveaux_tests_rapides_antibioresistance.aspx ​L'institut Joliot (et en particulier le SPI/LERI), une équipe de l'Hôpital Bicêtre APHP-Université Paris-Sud et NG Biotech ont développé de nouveaux tests rapides pour dépister certaines formes d'antibiorésistance dans les hôpitaux. Antibiotique ; Bactéries Résultat scientifique Mon, 13 Nov 2017 11:00:00 GMT Première caractérisation d'une NO-Synthase chez la picoalgue Ostreococcus tauri https://www.cea.fr/drf/joliot/Pages/Actualites/actualites/actualites_scientifiques/2017/Premiere_caracterisation_NO-Synthase_chez_Ostreococcus_tauri.aspx Une équipe du LSOD (I2BC@Saclay), en collaboration avec une équipe de l’Université Mar del Plata (Argentine), a pu caractériser pour la première fois une NO-Synthase de plantes. Les chercheurs ont montré que la NO-Synthase d’Ostreococcus tauri (pico plancton de l’étang de Thau) produisait de très fortes quantités de NO par rapport aux NO-Synthases humaines. Or, les plantes terrestres ne possèdent pas de NO-Synthases et le rôle biologique de cette enzyme demeure inconnu. Bactéries Résultat scientifique Mon, 23 Oct 2017 10:00:00 GMT L’interactome protéique des nanoparticules et son rôle dans leur impact cellulaire https://www.cea.fr/drf/joliot/Pages/Actualites/actualites/actualites_scientifiques/2017/Interactome_proteique_des_nanoparticules-.aspx ​Deux équipes de recherche animées par Odette Prat (BIAM) et Jean Armengaud (LI2D, Marcoule) se sont associées dans le cadre d'un financement ANR afin de faire progresser les connaissances sur l'importance de la nature des couronnes protéiques sur l'impact cellulaire des nanoparticules. Protéomique ; Nanosciences Résultat scientifique Fri, 20 Oct 2017 10:00:00 GMT Identification d’un mécanisme moléculaire commun à la schizophrénie et au trouble bipolaire https://www.cea.fr/drf/joliot/Pages/Actualites/espace_presse/Communiques/identification-mecanisme-moleculaire-commun-schizophrenie-trouble-bipolaire.aspx Une équipe de recherche en psychiatrie a montré qu’un variant génétique augmenterait le risque de développer la schizophrénie ou un trouble bipolaire. Santé & sciences du vivant ; Génomique ; Imagerie médicale Journalistes ; Chercheurs ; Grand public Saclay Communiqué de presse ; Actualité schizophrénie;trouble bipolaire;imagerie;génétique;IRM;neurosciences; Wed, 11 Oct 2017 10:00:00 GMT Un nouveau biomarqueur de la sénescence chez l’homme https://www.cea.fr/drf/joliot/Pages/Actualites/actualites/actualites_scientifiques/2017/nouveau_biomarqueur.aspx Dans un article publié le 10 mai dans Nature Communications, des équipes de l'institut Frédéric Joliot (SBIGeM, SPI) ont découvert qu'un nouveau variant d'histone appelé H2A.J s'accumule dans des fibroblastes humains en sénescence. Biomarqueurs ; Génomique Résultat scientifique Wed, 14 Jun 2017 10:00:00 GMT Une diversité moléculaire insoupçonnée chez une espèce dite «non-modèle»! https://www.cea.fr/drf/joliot/Pages/Actualites/actualites/actualites_scientifiques/2016/diversite_insoupconnee_crustace.aspx Une équipe du SPI/Marcoule, en collaboration avec le laboratoire d’écotoxicologie de l’Irstea de Lyon-Villeurbanne, a réalisé une analyse à très large échelle de la cinétique de plusieurs milliers de protéines d’un crustacé qui révèle une diversité insoupçonnée de vitellogénines, ces protéines de réserve servant de matériaux de construction lors des premiers stades de la vie. Toxicologie ; Protéomique Résultat scientifique Wed, 30 Nov 2016 11:00:00 GMT Pour l’environnement, la « protéomique 3.0 » relève le défi de la complexité ! https://www.cea.fr/drf/joliot/Pages/Actualites/actualites/actualites_scientifiques/2016/proteomique_3_defi_complexite.aspx Cette monographie proposée par Jean Armengaud (LI2D, Marcoule), spécialiste international en protéogénomique, décrit les possibilités décuplées de la protéomique nouvelle génération basée sur l’utilisation d’analyseurs orbitrap à ultra-haut-champ et de l’approche shotgun. Les champs d’innovations de la prochaine décennie seront notamment ceux où la diversité moléculaire est la plus élevée : population hétérogène d’organismes non-modèles, microbiote intestinal ou environnemental, et écosystèmes complexes. Protéomique Résultat scientifique Tue, 28 Jun 2016 10:00:00 GMT Premier génome mitochondrial d'une espèce éteinte de bison https://www.cea.fr/drf/joliot/Pages/ARCHIVES/IBITECS/Actualites/En_ce_moment_a_IBITECS/Actualites/2015/Premier-genome-mitochondrial-dune-espece-eteinte-de-bison.aspx Une équipe du CEA-IBITECS vient de déterminer l’intégralité du génome mitochondrial d’un spécimen de bison des steppes, à partir d’un fragment osseux datant de 19 000 ans et provenant de la grotte des Trois-Frères (Ariège). Génomique ; Biodiversité Résultat scientifique Wed, 17 Jun 2015 10:00:00 GMT