Cette thèse s’inscrit dans le cadre du développement d’outils chimiques innovants destinés à l’étude des interactions biomoléculaires au sein de systèmes vivants complexes. Elle repose sur la conception, la synthèse et l’application de sondes photo-activables et fluorogéniques permettant un contrôle spatiotemporel précis du marquage de protéines, en particulier chez Streptococcus pneumoniae, modèle pertinent pour l’exploration de la paroi bactérienne. Deux approches complémentaires ont été développées : une stratégie de marquage direct basée sur la photoactivation de nitrènes réactifs, et une approche de marquage de proximité photo-catalytique permettant l’activation sélective de sondes fluorogéniques sous lumière douce. Ces travaux contribuent à l’émergence de nouvelles sondes bioorthogonales de génération avancée et ouvrent des perspectives pour la cartographie fonctionnelle des protéines et l’identification de cibles antimicrobiennes potentielles.
​
​