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Postdocs

PsD-DRT-20-0059

Publié le 7 décembre 2023
PsD-DRT-20-0059
Domaine de rechercheTechnologies pour la santé et l’environnement, dispositifs médicaux

Domaine-SInstrumentation

ThèmeDéfis technologiques

Theme-SSciences pour l’ingénieur

Domaine
Technologies pour la santé et l’environnement, dispositifs médicaux Défis technologiques Instrumentation Sciences pour l’ingénieur DRT DTBS LSIV LSIV Grenoble
Intitulé de la proposition
Mesure de nématiques cellulaires actifs par microscopie sans lentille
Resumé
Au CEA-Leti, nous avons validé une plateforme de vidéo-microscopie sans lentille vidéo en enregistrant des milliers d’heures de cultures cellulaires. Et nous avons développé différents algorithmes pour étudier les fonctions cellulaires majeures, à savoir l’adhésion, la motilité, la division cellulaire et la mort cellulaire. Le projet de recherche du post-doc est d’étendre l’analyse des ensembles de données produites par la microscopie vidéo sans lentille. Le post-doc assistera notre partenaire dans la conduite des expérimentations et développera les algorithmes nécessaires pour reconstruire les images de la culture cellulaire dans différentes conditions. En particulier, les algorithmes de reconstruction holographique devront être à même de quantifier sur des échantillons cellulaires la différence de chemin optique (c’est-à-dire l’indice de réfraction multiplié par l’épaisseur). Les algorithmes existants permettent de quantifier les cellules isolées. Ils seront développés et évalués pour quantifier la formation de l’empilement cellulaire dans les trois dimensions. Ces algorithmes n’auront aucune capacité de sectionnement en Z comme par exemple la microscopie confocale, seule l’épaisseur du chemin optique sera mesurée Nous recherchons des personnes ayant obtenu un doctorat en traitement d’images et / ou en deep learning avec des compétences dans le domaine de la microscopie appliquée à la biologie.
Informations pratiques
Département Microtechnologies pour la Biologie et la Santé (LETI) Laboratoire Systèmes d’Imagerie pour le Vivant Laboratoire Systèmes d’Imagerie pour le Vivant
Date début de la proposition03/01/2020
email personne à contactercedric.allier@cea.fr
Personne à contacter
ALLIER Cédric CEA DRT/DTBS/SEVI DTBS/LSIV - Bât. 42 CEA-LETI, MINATEC 17 rue des Martyrs 38054 Grenoble Cedex 9 France 0438782411

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