​Sur ces données, nous établissons les stratégies d'analyse pertinentes, définissons et assurons le contrôle qualité nécessaire puis nous réalisons les analyses « bio-informatiques » sur les données. Pour réaliser ces tâches, nous nous appuyons sur des outils logiciels existants ou que nous développons, que nous déployons dans des workflows d'analyse (« pipelines bio-informatiques »). Nous développons également de nouvelles méthodologies ou approches pour exploiter les données générées par les dernières générations technologiques.

Nous évaluons également le dimensionnement informatique des problèmes soulevés et déployons nos calculs sur le calculateur HPC (High Performing Computing) déployé au TGCC  (Très Grand Centre de Calcul, Bruyères le Châtel, 3000 cœurs, 5 Po). La parallélisation de nos codes nous permet de répondre rapidement à des questions calculatoires complexes, et ainsi de garantir des analyses du génome humain en quelques heures.