​IDMIT collabore étroitement avec des partenaires industriels de confiance, et a établi deux accords cadres de collaboration avec des partenaires accueillis au sein même de ses locaux. Ces partenariats privilégiés permettent de développer des programmes communs, d'accéder à des technologies de pointe, et étendre l'offre de l'infrastructure à la communauté scientifique.

Ainsi, IDMIT entretient une collaboration étroite avec ONCODESIGN SERVICES, entreprise de service de recherche pharmaceutique (CRO) spécialisée dans la découverte de médicaments. Elle propose notamment des services précliniques, du vitro à la preuve de concept in vivo, dans les domaines du cancer, de l'inflammation et des maladies infectieuses.

IDMIT collabore également avec la société Life&Soft, qui propose des services et solutions en séquençage et informatique scientifique pour les sciences de la vie.

Grâce à ces collaborations, IDMIT bénéficie d'une synergie unique entre recherche académique et expertise industrielle, garantissant ainsi un haut niveau d'excellence scientifique et une réponse rapide aux enjeux de santé publique.