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Cibler les métaux pour lutter contre le staphylocoque doré


​​​Des chercheurs du CEA, du CNRS, d’Aix-Marseille Université et de l’INRA ont découvert un système original d’acquisition des métaux essentiels chez une bactérie pathogène, le staphylocoque doré. Il représente une nouvelle cible potentielle pour la conception d’un antibiotique. Ces résultats font l’objet d’une publication le 27 mai 2016 dans la revue Science.

Publié le 26 mai 2016

​Les métaux dits biologiques sont nécessaires à la vie. Les bactéries pathogènes développent des systèmes élaborés pour pallier la faible concentration de ces métaux essentiels dans leur environnement, en particulier à l’intérieur d’un hôte. Le cas du fer est notamment très documenté avec, chez certaines bactéries, la production de molécules appelées sidérophores qui captent spécifiquement le fer dans le milieu naturel. Les chercheurs ont identifié un nouveau piège à métaux produit chez la bactérie Staphylococcus aureus et baptisé staphylopine. 

Les chercheurs du CEA, du CNRS et d’Aix-Marseille Université, à Cadarache12   (Bouches-du-Rhône) et de l’INRA3 , en collaboration avec l'Université de Pau4  (Pyrénées-Atlantiques), et l’Université d’Umeå en Suède, ont mis en évidence le rôle des acteurs principaux qui permettent à ce pathogène d’incorporer un large panel de métaux essentiels, présents dans leur milieu, tels que le nickel, le zinc, le cobalt, le cuivre et le fer (Figure 1).  Trois enzymes dont la fonction était inconnue permettent la production de staphylopine par l’association de trois briques élémentaires (D-histidine, amino butyrate et pyruvate). Un système d’export permet à la staphylopine de sortir de la cellule pour piéger les métaux cibles du milieu extracellulaire. Le tandem staphylopine/métal peut alors être capté par la cellule via un système d’import spécifique (Figure 1). Si les chercheurs avaient bien observé une diminution de la prolifération de Staphylococcus aureus en l’absence de ces systèmes d’import/export, ils n’en comprenaient pas totalement l’origine.  La connaissance de ces modes de transport de la staphylopine pourrait donc ouvrir la voie à une nouvelle stratégie de lutte contre des bactéries pathogènes, ciblée sur leur dépendance vis-à-vis des métaux. 
D’une manière surprenante, la staphylopine est très proche de la nicotianamine, une molécule que l’on retrouve chez toutes les plantes et qui assure le transport des métaux essentiels, collectés au niveau des racines et à destination des organes aériens. La découverte de pièges à métaux similaires dans les trois règnes du vivant (archées, eucaryotes et maintenant bactéries) suggère une origine très ancienne de ce type de molécules.
Modèle fonctionnement staphylopine.jpg
Figure 1 : Modèle de fonctionnement de la staphylopine faisant intervenir trois enzymes de biosynthèse (bleu, gris et fuschia) utilisant des précurseurs communs, un exporteur (magenta) et un importeur de type transporteur ABC (ici, simplifié en orange). © DR

  1 From UMR 7265 CEA-CNRS-Aix-Marseille Université : Biam (CEA/’Institut de biosciences et biotechnologies d’Aix-Marseille’) ; BVME (Aix-Marseille Université et CNRS/’Biologie végétale et microbiologie environnementales’).
 2 Also in collaboration with a scientist of ‘Laboratoire d'ingénierie des systèmes macromoléculaires’ (CNRS/AMU) located in Marseille.
 3 Micalis : ‘Institut de microb​iologie au service de la santé’, UMR1319 Inra research centre, Jouy-en-Josas.
 4 Belonging to ’Institut des sciences analytiques et de physico-chimie pour l’environnement et les matériaux’ (CNRS/UPPA).​

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