OFFRES ET PRESTATIONS
Criblages à haut débit / à haut contenu
Tous nos criblages sont réalisés sur des modèles cellulaires mammifères, rapporteurs d'une ou plusieurs fonctions biologiques spécifiques. Certaines banques de perturbateurs (siARNs, miRNAs…) nécessitent, par leur nature, le recours à des cellules humaines. Notre approche privilégiée pour la quantification de tests cellulaires repose sur l'imagerie à haut contenu, qui permet de multiplexer les mesures phénotypiques directes à partir de marquages fluorescents et, dans certains cas, label-free (Fig. 2).
Figure 2 : Imagerie à haut contenu (High-Content Imaging,
HCI). Le HCI associe un microscope à fluorescence automatisé
(permettant l’acquisition d’images cellulaires en microplaques, typiquement au
format 96 ou 384 puits) à un logiciel de segmentation et d’analyse d’images.
Cette approche permet l’analyse simultanée et quantitative de multiples paramètres
cellulaires (taille, morphologie, localisation ou intensité des fluorescences…),
pour établir profilage phénotypique détaillé en réponse à une perturbation
cellulaire. Lorsque le HCI est intégré à une stratégies de criblage
systématique, on parle alors de High Content Screening (HCS).
La plateforme PICCEL travaille en étroite collaboration avec les autres plateformes de l'iRCM pour proposer les solutions de criblage les plus adaptées aux besoins de nos collaborateurs. Cette synergie s'appuie notamment sur la plateforme Cigex pour (établissement de lignées transgéniques), la plateforme de cytométrie (isolement et tri cellulaire, cribles sur cellules non-adhérentes), la plateforme d'irradiation (projets à composante radiobiologique) et la plateforme d'imagerie (imagerie confocale, modèles 3D et caractérisations cellulaires approfondies). L'équipe adopte une démarche qualité rigoureuse, garantissant la traçabilité et la confidentialité des résultats tout au long d'un projet de criblage.
La plateforme est en mesure de proposer un large éventail d'approches de criblage :
- Criblage génomique fonctionnelle par perte-de-fonction de gènes (banques de siARNs).
- Criblage miRNomique fonctionnelle par perte- ou gain-de-fonction de microARNs (banques d'anti-sens ou de mimiques des miARNs).
- Criblage de banques de petites molécules
- Solutions de criblage « sur mesure » : cribles combinatoires, modificateurs, différentiels, identification de cibles de miARNs par STaRs Assay (voir FAQ), cribles de banques « custom ».
Toutes ces approches visent à identifier et caractériser les gènes, microARNs ou composés chimiques clés impliqués dans une fonction biologique ou une voie métabolique d'intérêt. Les candidats ainsi sélectionnés constituent autant de biomarqueurs ou de leviers pour le développement de nouvelles stratégies exploratoires, à visées fondamentales ou thérapeutiques.
Services de routine
Notre plateforme propose aussi diverses prestations de routine :
- Conception, développement et optimisation de tests cellulaires miniaturisés (format 96 et 384 puits).
- Automatisation de traitements cellulaires (ex : transfections, études dose-réponse, traitements pharmacologiques, etc…).
- Acquisitions et quantification algorithmique d'images pour le profilage phénotypique.
- Traitement et analyse statistique de jeux de données de grandes dimensions
Tarifs horaires (HT)* des prestations de la plateforme PARi (2022)
Unité d'oeuvre
| CEA
| Académique
| Europe
| Industrie
|
Imagerie à haut contenu
| 11,21 €
| 12,66 €
| 91,00 €
| 129,46 €
|
Automate pipeteur-diluteur
| 17,81 €
| 20,13 €
| 99,10 €
| 134,28 €
|
Robotique et fluidique de paillasse
| 41,42 €
| 46,81 €
| 99,52 €
| 109,04 €
|
Lecteur de plaque
| 36,53 €
| 41,28 €
| 87,58 €
| 94,16 €
|
* Ces tarifs correspondent aux coûts horaires standard d'accès aux équipements de la plateforme. Les réactifs et consommables éventuels ne sont pas inclus, et font l'objet d'un devis et d'une facturation complémentaires.
EQUIPEMENTS ET RESSOURCES
- Automate pipeteur-diluteur avec tête 96 canaux + 8 canaux indépendants (Microlab Star V, Hamilton) équipé d'un système de soufflerie à filtration HEPA.
- Microscope de criblage à haut contenu, doté de 7 canaux de couleurs + transmission (Eclipse Ti2e, Nikon + Spinning-Disk Crest V2, CrestOptics). Accès via la plateforme d'imagerie.
- Lecteur de microplaques multimode (fluo/lumino/spectro) avec injecteur pour mesure flash (ClarioStar, BMG Labtech).
- Distributeur fluidique pour microplaques (Multidrop combi, Thermo).
- Laveur de microplaques (ELX-405, Biotek).
- Compteur de cellules (Celldrop FLi, Denovix).
- Banques de perturbateurs biologiques :
· Banque siARN « On-Target Plus » pangénomique humaine (18000
gènes, 4 siARNs/gène, banques pool et siARNs déconvolués, Horizon Discovery).
· Banque d'inhibiteurs des miARNs, pangénomique humaine (994 LNAs, 1
LNA/miARN, miRBase V19, Exiqon).
· Banque de surexpression des miARNs humains (2050 « mimiques », 1
« mimique »/miARN, miRBase V19, Horizon Discovery).
· Banque d'inhibiteurs des miARNs humains (2050 inhibiteurs, 1 hairpin/miARN,
miRBase V19, Horizon Discovery).
· Banque de drogues repositionnables (1520 petites molécules, 98%
« FDA-approved », Prestwick Chemicals).
MODALITES D'ACCES
Lien vers la charte de la plateforme PARI
(conditions d'utilisation)