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Laboratoire de Génomique et Radiobiologie de la Kératinopoïèse - LGRK

Genomics and Radiobiology of Keratinopoiesis - LGRK 


Publié le 19 juin 2023




Nicolas FORTUNEL
Responsable du Laboratoire
Tél : +33 (0)1 60 87 34 92
nicolas.fortunel@cea.fr

Genopole
2 avenue Gaston Crémieux
91000 EVRY cedex

Secrétariat:
Aurélie GOURET
Tél: +33 (0)1 46 54 98 66
aurélie.gouret@cea.fr
​MODELE D'ETUDE

La peau fournit un modèle biologique adapté pour étudier les cellules souches des organes et tissus adultes chez l’humain. En effet, plusieurs réservoirs de cellules souches qui y résident, notamment des cellules souches épithéliales au sein du tissu épidermique. Notre laboratoire, le LGRK, étudie les propriétés intrinsèques et la capacité régénératrice des cellules souches de la peau, ainsi que les dialogues siégeant au sein de l’environnement cutané les impliquant. L’exposition aux rayonnements ionisants est étudiée comme modèle d’exploration des perturbations cutanées induites par l’exposome.

​AXES DE RECHERCHE

L​es recherches menées par le LGRK sur la peau humaine se déclinent selon trois axes :

​1 – Déterminants moléculaires du caractère 'cellule souche' ou 'stemness'.

Cet axe de recherche amont porte sur la connaissance des caractéristiques fondamentales des cellules souches et progéniteurs épithéliaux de l'épiderme interfolliculaire et du follicule pileux. Les points d'intérêt comprennent la recherche de critères phénotypiques associés au caractère 'cellule souche', ainsi que le décryptage des réseaux de régulation de la balance 'immaturité versus différenciation'. La voie du TGFB1 et les facteurs de transcription associés sont notamment étudiés pour leur implication dans le contrôle du caractère 'stemness'. Plus globalement, ces recherches intègrent le génome codant conventionnel (gènes codant le protéome), et l'épigénome (gènes produisant des transcrits non codants), en particulier la classe des ARNs longs non codants (lncRNAs).

2 – Substituts cutanés issus de culture.

Cet axe translationnel a pour objet l'apport de concepts et d'innovations au bénéfice du domaine des thérapies cellulaires et tissulaires cutanées. Une première piste de travail porte sur le développement d'effecteurs promoteurs d'une action pro-'stemness' permettant une préservation plus efficace des cellules souches épidermiques ex vivo, dans le contexte d'architectures de bio-ingénierie de substituts de peau. Le gain visé concerne la qualité de régénération. Une seconde piste de travail concerne la problématique de rejet immunitaire, qui restreint les champs d'utilisation de greffons allogéniques. L'approche explorée consiste à vectoriser des molécules promotrices d'un signal tolérogène dans des cellules de peau, dans la perspective de générer des greffons présentant une immunogénicité atténuée. 

Sur cet axe, et dans le cadre des 'Programmes et équipements prioritaires de recherche' (PEPR) 'Biothérapies – Bioproduction', le LGRK est coordinateur d'un programme ciblé portant sur les thérapies cellulaires et tissulaires cutanées : acronyme 'Bioengineered Skin France'.

3 – Radio-pathologies cutanées.

Cet axe porte sur les conséquences cutanées des stress génotoxiques induits par les rayonnements ionisants (RI), en particulier les expositions de la peau saine dans le contexte d'applications médicales (imagerie, radiothérapies). Un premier aspect étudié est l'impact de cet exposome médical sur l'intégrité et les fonctions des cellules souches et des progéniteurs de l'épiderme. Un aspect d'intérêt concerne les fibroblastes dermiques, étudiés pour leur statut cellules effectrices primaires du développement des fibroses cutanées radio-induites. Les effecteurs moléculaires de la physiopathologie sont étudiés au niveau du génome codant et du transcriptome non codant. Des cibles candidates pour la conception d'approches correctives sont recherchées. 


RESSOURCES INTERNES

  • Cellules primaires de peau humaine (cultures clonales, long terme, organoïdes cutanés en 3D).
  • Cytométrie en flux (trieur MoFlo ASTRIOS, analyseur NovoCyte) [plateforme CEA-Genopole].
  • Irradiation expérimentale (générateur RX Faxitron Multi Rad 350) [plateforme CEA-Genopole].
  • Micropuces transcriptome (Affymetrix Clariom D) ; PCR / RT-PCR digitale en gouttelettes (BioRad).
SELECTION DE PUBLICATIONS

​​​Coutier J, Auvré F, Lemaître G, Lataillade J-J, Deleuze J-F, Roméo PH, Martin MT, Fortunel NO. MXD4/MAD4 regulates human keratinocyte precursor fate. J Invest Dermatol. 2023 Jan;143(1):105-114.e12. PMID: 36007550​ - DOI: 10.1016/j.jid.2022.07.020 ​​Full-text: https://www.jidonline.org/article/S0022-202X(22)01778-X/fulltextxx

​​Mestrallet G, Auvré F, Schenowitz C, Carosella ED, LeMaoult J, Martin MT, Rouas-Freiss N, Fortunel NO. Human keratinocytes inhibit CD4+ T-cell proliferation through TGFB1 secretion and surface expression of HLA-G1 and PD-L1 immune checkpoints. Cells. 2021 Jun 8; 10(6):1438. PMID: 32998444 - DOI: 10.3390/cells10061438 Full-text: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC7601001/pdf/cells-09-02188.pdf

​Cavallero S, Neves Granito R, Stockholm D, Azzolin P, Martin MT, Fortunel NO. Exposure of human skin organoids to low genotoxic stress can promote epithelial-to-mesenchymal transition in regenerating keratinocyte precursor cells. Cells. 2020 Aug 18; 9(8):1912. PMID: 32824646 - DOI: 10.3390/cells9081912 Full-text: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC7466070/pdf/cells-09-01912.pdf

​​Fortunel NO, Chadli L, Coutier J, Lemaître G, Auvré F, Domingues S, Bouissou-Cadio E, Vaigot P, Cavallero S, Deleuze JF, Roméo PH, Martin MT. KLF4 inhibition promotes the expansion of keratinocyte precursors from adult human skin and of embryonic-stem-cell-derived keratinocytes. Nature Biomed Eng. 2019 Dec; 3(12):985-997. Epub 2019 Oct 21. PMID: 31636412. (IF 2021: 29.234). - DOI: 10.1038/s41551-019-0464-6 Full-text: https://rdcu.be/b8JPr

TUTELLES ET SOUTIEN​​
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