Le Service d'Ingénierie Moléculaire pour la Santé (SIMoS) mène des recherches axées sur : (I) le développement d'outils moléculaires innovants destinés à l'étude de protéines impliquées dans divers processus physiopathologiques ; (II) la conception et l'optimisation d'anticorps de nouvelle génération présentant une meilleure développabilité et une immunogénicité réduite ; et (III) l'identification et le développement préclinique de composés bioactifs issus de sources naturelles, dotés d'un potentiel diagnostique et thérapeutique.
Nous développons des inhibiteurs à large spectre qui ciblent les toxines bactériennes en perturbant les mécanismes de trafic intracellulaire des cellules hôtes. En modulant ces voies, nos composés présentent également des activités antivirales, antibactériennes contre les bactéries intracellulaires et antiparasitaires. Nos travaux incluent également la conception d'un fragment de la toxine diphtérique comme inhibiteur de l'HB-EGF pour le traitement de la glomérulonéphrite à croissants, une maladie rénale rare.
Nous développons des technologies innovantes à l'interface de la chimie-biologie, de la chimie médicinale, de la chemoprotéomique, de l'imagerie moléculaire et de la nanomédecine afin d'étudier les protéines au sein de systèmes biologiques complexes. Nos recherches portent sur le développement d'outils diagnostiques et thérapeutiques ciblant les maladies inflammatoires chroniques, la fibrose, les maladies cardiovasculaires, les troubles auto-immuns et les maladies neurodégénératives.
L'équipe développe de nouveaux ligands basés sur des anticorps pour un large éventail d'applications, notamment thérapeutiques, d'imagerie et diagnostiques. Elle se concentre en particulier sur la conception d'anticorps à haute affinité, à sélectivité contrôlée et à faible immunogénicité, permettant leur administration chez l'homme tout en minimisant le risque de réponses immunitaires.
Notre équipe combine l'ingénierie biomoléculaire, la biologie synthétique et l'intelligence artificielle générative (IA) pour concevoir des systèmes biologiques et des protéines innovants. Notre approche intègre des méthodes à haut débit (analyses multiplexées des effets des variants, MAVE ; séquençage à haut débit, NGS) ainsi que des technologies propriétaires telles que l'assemblage d'ADN
in vitro (SLiCE
SBE) et l'ingénierie du génome bactérien.
- Immunogenicité des protéines et anticorps (Bernard Maillère)
Nos travaux portent sur l'identification des séquences reconnues par les lymphocytes T CD4 (épitopes T), la caractérisation de la clonalité des répertoires de lymphocytes T spécifiques des protéines thérapeutiques, la définition du phénotype effecteur ou régulateur des lymphocytes T CD4 spécifiques de ces protéines, ainsi que le développement de stratégies visant à générer des molécules désimmunisées, c'est-à-dire des molécules qui n'induisent plus de réponse immunitaire.
Notre activité de recherche se concentre sur la découverte, la synthèse, la caractérisation pharmacologique, l'ingénierie et l'évaluation préclinique in vivo de peptides naturels et de phycotoxines, dans le but de développer des agents thérapeutiques et diagnostiques innovants. Nous étudions en particulier des peptides purifiés à partir de venins et des peptides endogènes, ainsi que des phycotoxines marines ciblant les récepteurs couplés aux protéines G (RCPG) et les canaux ioniques, compte tenu des rôles physiopathologiques centraux de ces cibles moléculaires. Parallèlement, nous menons des travaux de neuroscience moléculaire et cellulaire visant à élucider les mécanismes sous-jacents à l'oligomérisation de l'Aβ1‑42.