Pour comprendre comment les neurones se développent, se connectent ou réagissent à des traitements, les chercheurs doivent mesurer la longueur de leurs prolongements : les neurites. Une tâche essentielle… mais encore souvent réalisée à la main, image par image. Cette étape fastidieuse limite fortement les études à grande échelle pourtant indispensables aujourd'hui. CABaNe apporte une solution simple et gratuite qui automatise totalement cette mesure, rendant ces analyses enfin accessibles à tous les laboratoires.
L'outil analyse automatiquement les images de neurones en reconnaissant les noyaux, le corps cellulaire et surtout les neurites, qu'il mesure sans intervention humaine. CABaNe fonctionne sur n'importe quel ordinateur équipé du logiciel de traitement d'images scientifiques ImageJ, sans expertise technique particulière. Face aux mesures manuelles et à certaines approches de machine learning, il s'avère bien plus rapide tout en offrant une grande précision.
CABaNe démocratise ainsi l'analyse à haut débit des neurones et permet de traiter, en quelques minutes, des données auparavant difficiles à exploiter. Dans les prochaines années, il pourra servir de base à de futurs outils et à l'étude d'autres types de cellules ou paramètres.
Exemple d'image de neurones différenciés. CABaNe segmente automatiquement les noyaux, les corps cellulaires et les neurites, montrant comment l'outil reconnaît et mesure les prolongements neuronaux sans intervention humaine.